Köln - Basel hat eine Direktverbindung.

Um in der Schweiz zu starten gäbe es viele Optionen und eigentlich ist alles sehr gut mit dem Zug erreichbar. Die Zugbillette sind ohne Halbtax Abo halt wirklich sehr teuer für die kurzen Strecken.

Im Westen z.B. Genf oder Lausanne. Oder Berner Oberland (Spiez, Interlaken, ...).
Im Osten z.B. Chur oder Sargans.

Oder halt in Bern, Luzern oder Zürich starten dann ist man eigentlich nach ein paar Stunden Radfahren auch in den Alpen.

Achtung: Intercity (IC) benötigt eine Fahrradreservierung. Interregio (IR) benötigt keine Fahrradreservierung und hat dementspechend auch keine Zugbindung (ausser man kauft online ein Sparticket).